氣體經過篩板時對篩板上的液層產生鼓泡效果，增加了氣液傳質的表面積和湍動狀態，提高了傳質速率，二氧化硫與堿液發生氣液傳質，然后進一步提高了脫硫除塵器的效果。脫硫生成物隨水流到脫硫塔底部，從溢水孔排走，在筒體底部設有水封槽以防止煙氣從底部泄漏，另備有整理孔以便于進行筒體底部人工整理沉灰（也可主動清灰）。
脫硫廢水由底部溢流孔排出進入沉積池，沉積中和再生，循環使用（雙堿法）。凈化后的氣體，經過筒體上部經除霧器除霧后排出，然后到達除塵脫硫目的。
鍋爐煙氣脫硫塔結構原理： 含煙塵及硫氧化物的煙氣經過進口煙道進入筒體，含有［OH-］離子的堿性吸收液分別從濾泡除塵脫硫塔上中下部由螺旋噴嘴噴出，構成與煙氣成逆向的多排高速霧化水幕，增加了煙塵硫氧化物與水的磕碰概率，并充分利用霧化液滴的速度來形成很高的氣液相對速度，以確保除塵器的除塵和脫硫效果。